Описание

Лимфома – группа заболеваний, характеризующихся онкологическими изменениями лимфатической ткани: лимфоциты (клетки иммунитета) неконтролируемо разрастаются до огромных размеров. Видоизмененные клетки быстро распространяются по организму, поражая жизненно важные органы: в первую очередь – костный мозг, лимфатические узлы и вилочковую железу.

Основные причины лимфом:

• неблагоприятная наследственность (генетические риски)
• внешние факторы (повышенный радиационный фон, химическое загрязнение)
• иммунная недостаточность (вирус иммунодефицита или Эпштейна-Барр значительно снижают количество иммунных клеток и не препятствуют их мутациям)
• терапия при операционных вмешательствах (применение препаратов, подавляющих иммунную функцию)
• возрастной и гендерный показатель
• аутоиммунные и прочие группы заболеваний (ревматоидные артриты, волчанка)
• инфекции (герпес, хронические пневмонии, гепатит, хеликобактер пилори).

Химиотерапия опухоли сопровождается массой побочных эффектов, поэтому возможно сократить количество этапов её применения без ущерба для качества лечения.

Способ корректно определять эффективность проведения химиотерапии для широкого спектра опухолей в клинической практике отсутствует. В настоящее время используют устаревшие для данной задачи методы: УЗИ, МРТ, КТ (и другие), биохимические маркеры крови, которые обладают низкой достоверностью.

При разрушении клеток опухоль секретирует в кровоток ДНК (сцДНК), которую можно проанализировать на наличие мутаций, характерных для опухоли и, в случае их отсутствия – прекратить химиотерапию. Данный подход называется жидкостной биопсией. Опубликованы работы, описывающие возможность использования таких молекулярных маркеров для оценки эффективности лечения. [Mamaev et al., 2018]. Указывается важность таких исследований.

Цель данного проекта – разработка прототипа тест-системы для анализа мутаций сцДНК, характерных для опухолей методом нанопорового секвенирования (на примере лимфом). Ранее коллективом авторов в рамках проекта, поддержанного фондом содействия инновациям (договор №158ГС1ИИС12-D7/79663 от 14.10.2022) был апробирован подход для анализа концентрации миРНК в биологических образцах методами секвенирования нового поколения. Полученные результаты будут использованы в качестве существенного задела в данном проекте.

На рынке присутствует комплексное предложение от компании Roche (https://genetico.ru/onkogen/foundation-one), однако время анализа (>30 суток) и стоимость (375 тыс. руб.) не позволяют широко использовать данную технологию.

Компания Roche предлагает исследование более 300 генов, связанных со всеми типами рака.

Компания Омнином разрабатывает более таргетную панель, предназначенную для оценки эффективности терапии только лимфом по 30 (ориентировочно) генам, что позволит сократить время (до 14 дней) и стоимость (до 50 тыс. руб.), и сделать тест более доступным.